Les factions sont des groupes réunissant des idéaux, encore des capacités spéciales. Les individus qui les composent peuvent être humains ou encore originaire d'une autre planète.
Beaucoup d'entre elles sont présente par le biais de certains PNJ au Fort Tarsis, le joueur aura donc l'occasion de rencontrer nombre d'entre elles au cours de son aventure. Certaines lui voudront du bien et d'autre ne chercheront qu'à l'éliminer.
D'autres comme la Légion de l'Aube ou les Démiurges ont de nos jours disparus.